Anfang der 90er-Jahre produzierte Weatherall das Album "Screamadelica" der Band Primal Scream. Durch den internationalen Erfolg des Albums wurde auch Weatherall einem breiteren Publikum bekannt. Sein Remix zum Song "Soon" von My Bloody Valentine wurde später weltweit gefeiert. In Verlauf seiner Karriere arbeitete er außerdem mit Künstlern wie Björk, New Order, Stereo MCs und den Chemical Brothers.